Benjamin Breckinridge Warfield nació el 5 de noviembre de 1851, en una propiedad cerca de Lexington, Kentucky, hijo de una familia influyente y ligada a la Iglesia Presbiteriana. Desde temprano mostró un talento inusual para los estudios, lo que lo llevaría a Princeton siendo aún adolescente.
Se graduó en la Universidad de Princeton en 1871, con solo diecinueve años y los mayores honores de su promoción. Cursó el Seminario de Princeton entre 1873 y 1876 y, poco después de graduarse, pasó cerca de dos años estudiando con maestros teológicos en Leipzig, Alemania, donde tuvo contacto directo con la crítica bíblica que más tarde combatiría.
Se casó con Annie Kinkead el 3 de agosto de 1876, en Lexington, Kentucky, y poco después viajó con su esposa a Alemania, donde continuaría sus estudios. Durante una caminata en las montañas Harz, la pareja fue sorprendida por una tormenta violenta que dejó a Annie con secuelas nerviosas duraderas. Ella vivió gran parte de su vida adulta como inválida, y Warfield la cuidó hasta la muerte de su esposa, en 1915.
Ordenado ministro presbiteriano en 1879, enseñó Nuevo Testamento en el Western Theological Seminary, en Pensilvania, donde ya se desempeñaba como instructor desde 1878. En 1887 asumió la Cátedra Charles Hodge en Princeton, dedicada a la teología didáctica y polémica, cargo que ocupó hasta el final de su vida.
En 1881 publicó, junto con A. A. Hodge, el artículo Inspiration, que ayudó a formular la doctrina moderna de la inerrancia bíblica. A lo largo de su carrera, insistió en que la Escritura es theopneustos, literalmente exhalada por Dios, y por eso confiable en todo lo que afirma.
Fue también un polemista fervoroso: se convirtió en uno de los principales opositores teológicos del profesor Charles Briggs, blanco declarado de sus críticas sobre la inspiración bíblica. Briggs terminó condenado por herejía por la Asamblea General en 1893, un episodio que revela el lado más combativo de Warfield, dispuesto a enfrentamientos institucionales duros en defensa de sus convicciones.
Escribió contra la segregación racial dentro de las iglesias presbiterianas estadounidenses, defendiendo la dignidad de los hermanos negros en la fe. Aun así, sus textos sobre la raza llevaban el paternalismo común a los hombres blancos del sur de Estados Unidos de su generación, un límite reconocido por los historiadores actuales.
Murió en Princeton el 16 de febrero de 1921, ocho años antes de la reorganización del seminario que llevaría a la fundación del Westminster Theological Seminary. Sus libros sobre la inspiración, los milagros y la salvación siguen imprimiéndose y aún forman a pastores y misioneros hoy.